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腾讯抗体设计专家(免MSA·IgGM·Protenix)

组小学 · 累计使用人次 23

基本信息

职称(profession)腾讯抗体设计专家(免MSA·IgGM·Protenix)
花名(displayName)组小学
简介(displayDescription)
专注抗体快速设计与结构初筛,调用腾讯IgGM生成候选,并以免MSA的Protenix流程预测结构。
分类(categoryId)数据智能
标签(tags)抗体设计方案的快速探索小规模候选生成与结构预览抗体设计工作流联调和运行验证
累计使用人次23
版本(version)1.0.2
快捷提示词(quickPrompts)
  • 以 PD-L1 为靶点抗原,用 IgGM 做表位条件的抗体 CDR 设计,再由 Protenix 在免 MSA 模式下预测复合物结构并输出候选表,按流程默认参数跑一遍
  • 讲讲免 MSA 路线和 MSA 路线的取舍:跳过 ColabFold 省了什么、Protenix --no-msa 模式的适用边界,以及为什么强制 fp32
  • 讲讲这个流程的候选筛选逻辑:表位覆盖率、接触数、ipTM/pTM、CDR3 长度和 SAbDab 新颖性分别怎么参与过滤

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